ایشان در ایام تحصیلی، برای تدریس، اوقات معینی را صرف مطالعه منابع و متون اصلی می‌کند. در اوقات فراغت کتاب‌های عادی تاریخی، اجتماعی رجالی و حدیثی را به‌دقت مطالعه می‌کرد و گاهی به مقابله یا تصحیح برخی نسخ خطی حدیثی با دیگر نسخ خطی حدیثی با دیگر نسخ یا تهیه فیش و تنظیم یادداشت‌های گردآوری شده و یا ثبت آنها می‌پرداخت. کمتر کتاب یا نوشته‌ای یافت می‌شود که ایشان مطالعه کرده باشد و در حاشیه آن توضیح یا یادداشتی نگاشته نباشد. به‌طور معمول در حاشیه کتاب‌های تاریخی و اجتماعی تذکرات مفید، اشتباهات، تحریفات و تفسیر عبارات دشوار را می‌نگاشتند. در بررسی و مطالعه کتاب‌های حدیثی و رجالی بیشتر به اسناد و احوال روایان می‌پرداخت و حواشی ارزشمند ایشان بر این نوع کتاب‌ها پر از فواید علمی است که نظر هر پژوهشگری را به خود جلب می‌کند. از ایشان یادداشت‌ها و نوشته‌های فراوانی موجود است که حاصل بیش از شصت سال تحصیل، تدریس و تحقیق می‌باشد که به برخی از آنها اشاره می‌شود.

الف) آثار فقهی و اصولی:

1. تحریرالجواهر و فتاوی الجواهر کتاب الحج.

2. شرح بر مبحث حج کتاب العروة‌الوثقی.

3. تعلیقه بر متن و سند مباحث حج و کتاب جامع احادیث‌الشیعه.

4. تقریرات مباحث: حج، اجاره، خمس، و نکاح به صورت جزوه.

5. تقریرات پراکنده از دروس خارج فقه و اصول اساتید.

6. تقریرات مباحث تعادل و تراجیح، قاعده فراغ و تجاوز.

7. مناسک حج به زبان‌های فارسی و عربی، چ اول، 1379 ش.

8. مختصر مناسک (مناسک زائر)، چ اول، 1377 ش.

9. رساله توضیح المسائل، چ اول، 1375 ش.

ب) آثار حدیثی و رجالی:

10. تعلیقه (پیرامون اسناد) بر اکثر کتاب حدیثی و مصادر.

11. تعلیقه بر رجال شیخ طوسی، رجال نجاشی.

12. تصحیح کتاب رجال نجاشی، چ انتشارات اسلامی وابسته به جامعه مدرسین.

13. دروس درایه و قواعد عامه علم رجال.

14. فهارس رجالی بر اسناد اکثر کتب حدیثی (جز کتب اربعه) با دو روش تربیت الاسانید و اعلام الاسانید و تعیین راوی و مروی‌عنه.

15. اسناد اصحاب اجماع با تعیین راوی و مروی‌عنه.

ج) مقالات و...

1. حاشیه رساله عدیمة‌النظیر فی احوال ابی‌بصیر، چاپ شده در میراث حدیث‌الشیعه، ج‌3، ص‌447، انتشارات دارالحدیث قم.

2. تعلیقه بر «رسالة فی ان الوتر ثلاث رکعات» تألیف آیت‌الله سیدمهدی روحانی، چاپ انتشارات اسلامی وابسته به جامعه مدرسین.

3. مقاله پیرامون مولف کتاب تبصرة‌العوام، چ مکتب اسلام، ش 8، 9، 10، سال اول، 1337 ش.

4. مقاله پیرامون فهرست شیخ منتخب‌الدین، یادنامه علامه امینی، ص 33.

5. ابعاد شخصیت شیخ انصاری، مصاحبه، چ کنگره شیخ انصاری، 1373 ش.

6. گفتاری پیرامون شخصیت علامه شیخ محمدتقی شوشتری، مجله کیهان فرهنگی، س 1364، ش 1، ص 12.

7.  خاندانی بزرگ درباره شخصیت علمی امام موسی صدر تاریخ فرهنگ معاصر، ش 5، ص 109.

8. ابوالعباس نجاشی و عصر وی، مجله نور علم، س اول، ش 11 و 12.1

..............................................

  پی نوشت‌

1. جزوه نگاهی به زندگی فقیه محقق حضرت آیت‌الله حاج سید موسی شبیری زنجانی موجود در دفتر معظم‌له، و یادداشت‌های حجت‌الاسلام والمسلمین آقای حاج سید جواد شبیری زنجانی.